我的R语言和生信基础分析笔记

• R的简单教程--01基础

  -----发布于2024-07-21

  华中科技大学–组学数据分析与可视化课程–大二上课程笔记第一部分，包括基本数据类型、基础语段、文件读写、一些常用函数等

• R的简单教程--02进阶-1

  -----发布于2024-07-20

  华中科技大学–组学数据分析与可视化课程–大二上课程笔记第二部分，包括管道运算符、dplyr包、tidyr包、字符串处理、使用循环的各种方式、基础绘图等

• R的简单教程--03进阶-2

  -----发布于2024-07-19

  华中科技大学–组学数据分析与可视化课程–大二上课程笔记第三部分，包括并行计算、ggplot2基础、常用统计学函数、参数/非参数检验、线性/非线性回归等

• R的简单教程--04ggplot2进阶与实战

  -----发布于2024-07-18

  华中科技大学–组学数据分析与可视化课程–大二上课程笔记第四部分，包括更多画子图的方式、为图增加公式及统计信息、堆叠与并列柱状图、画图函数的计算方法、图的主题以及实战案例等

• b站生信课程01

  -----发布于2024-07-01

  b站生信课程生信从0到1学习系列笔记

• b站生信课程02-1

  -----发布于2024-07-01

  b站生信课程TCGA及GEO数据挖掘入门必看P3-P7笔记——数据下载与处理部分

• b站生信课程02-2

  -----发布于2024-06-30

  b站生信课程TCGA及GEO数据挖掘入门必看P8-P17笔记——差异表达分析、cox与lasso回归、富集分析、KM生存分析

• b站生信课程02-3

  -----发布于2024-06-29

  b站生信课程TCGA及GEO数据挖掘入门必看P18-P26笔记——样本聚类、ROC曲线、线上画Venn图、列线图、免疫组化图片、免疫细胞浸润分析、免疫功能分析

• b站生信课程02-4

  -----发布于2024-06-28

  b站生信课程TCGA及GEO数据挖掘入门必看P27-P34笔记——突变数据处理、预测免疫治疗反应和药物敏感性、免疫浸润评分、临床信息相关性分析、GEO差异表达分析

• b站生信课程02-5

  -----发布于2024-06-27

  b站生信课程TCGA及GEO数据挖掘入门必看P35-P43和P50笔记——GTEx和ICGC数据的下载与整理、泛癌差异基因箱线图、WGCNA、PCA、批量生存分析、自定义通路富集打分、IPS预测免疫治疗反应

• b站生信课程02-6

  -----发布于2024-06-26

  b站生信课程TCGA及GEO数据挖掘入门必看P44-P55笔记——基因在染色体位置、拷贝数突变频率、二分类列线图、miRNA下游靶基因、二分类cox分析、生存状态详细分析、TCGA和GEO数据下载补充

• b站生信课程02-7

  -----发布于2024-06-25

  b站生信课程TCGA及GEO数据挖掘入门必看P56-P62笔记——筛选特征基因（二分类LASSO、随机森林、SVM-RFE）、临床信息三线表、GEO的基因差异分析和bayes差异表达分析、TCGA甲基化数据注释

• b站生信课程02-8

  -----发布于2024-06-24

  b站生信课程TCGA及GEO数据挖掘入门必看P63-P69笔记——相关性分析、批次矫正前后PCA图、更多火山图、IOBR包、免疫检查点基因差异分析